Paquet : kalign (1:3.4.0-1 et autres)

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Paquets similaires :

Alignement séquentiel multiple global et progressif

Kalign est un outil en ligne de commande pour l'alignement de séquences biologiques (ADN, ARN, proteïnes). Il utilise l'algorithme de concordance de chaînes Muth-Manber pour améliorer la précision et la vitesse de l'alignement. Il utilise une démarche d'alignement globale, progressive, enrichie par l'usage d'un algorithme de concordance de chaînes approché pour calculer les différences de séquence et par l'incorporation des correspondances locales dans tout autre alignement global.

Étiquettes: Biologie: Clustal et ALN, Protéines, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

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enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

enh: bioperl-run

scripts d'enveloppe BioPerl
enh: t-coffee

alignement multiple de séquences

Télécharger kalign

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	85,7 ko	409,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1:3.4.0-1+b1	134,3 ko	1 127,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1:3.4.0-1+b1	86,8 ko	407,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1:3.4.0-1+b1	79,9 ko	305,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1:3.4.0-1+b1	77,4 ko	245,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	83,3 ko	324,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1:3.4.0-1+b1	88,8 ko	341,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1:3.4.0-1	105,1 ko	557,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	80,5 ko	293,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1:3.4.0-1+b1	84,1 ko	421,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	92,4 ko	471,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1:3.4.0-1+b1	99,9 ko	471,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1:3.4.0-1+b1	88,3 ko	287,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1:3.4.0-1+b1	96,4 ko	371,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	88,8 ko	278,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	75,0 ko	2 138,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1:3.4.0-1+b1	90,2 ko	329,0 ko	[liste des fichiers]