套件：kalign（1:3.4.0-1）

kalign 的相關連結

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維護小組：

外部的資源：

主頁 [msa.sbc.su.se]

相似套件：

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Muth-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment.

標籤: 生物學: Clustal/ALN, 蛋白質, 領域: field::biology, field::biology:bioinformatics, 實做語言: implemented-in::c, interface::commandline, 角色: 程式, 範圍: 實用程式, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, 處理: 需要一個額外的標籤

其他與 kalign 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

下載 kalign

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	85。7 kB	408。0 kB	[檔案列表]
amd64	134。4 kB	1，126。0 kB	[檔案列表]
arm64	83。7 kB	406。0 kB	[檔案列表]
armel	79。2 kB	304。0 kB	[檔案列表]
armhf	76。9 kB	244。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	83。3 kB	323。0 kB	[檔案列表]
i386	88。1 kB	340。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	105。1 kB	557。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	80。4 kB	292。0 kB	[檔案列表]
mips64el	82。0 kB	420。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	91。3 kB	470。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	99。4 kB	470。0 kB	[檔案列表]
riscv64	88。3 kB	286。0 kB	[檔案列表]
s390x	96。2 kB	370。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	88。4 kB	277。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	75。2 kB	2，137。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	91。4 kB	328。0 kB	[檔案列表]