パッケージ: kalign (1:3.4.0-1)

kalign に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [msa.sbc.su.se]

類似のパッケージ:

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。アライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アルゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能がさらに強化されています。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の kalign 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

kalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	85.7 kB	408.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	134.4 kB	1,126.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	83.7 kB	406.0 kB	[ファイル一覧]
armel	79.2 kB	304.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	76.9 kB	244.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	83.3 kB	323.0 kB	[ファイル一覧]
i386	88.1 kB	340.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	105.1 kB	557.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	80.4 kB	292.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	82.0 kB	420.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	91.3 kB	470.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	99.4 kB	470.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	88.3 kB	286.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	96.2 kB	370.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	88.4 kB	277.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	75.2 kB	2,137.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	91.4 kB	328.0 kB	[ファイル一覧]