Pakiet: kalign (1:3.4.0-1)

Odnośniki dla kalign

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego kalign:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [msa.sbc.su.se]

Podobne pakiety:

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

enh: bioperl-run

Nakładki na BioPerl: skrypty
enh: t-coffee

Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	85,7 KiB	408,0 KiB	[lista plików]
amd64	134,4 KiB	1 126,0 KiB	[lista plików]
arm64	83,7 KiB	406,0 KiB	[lista plików]
armel	79,2 KiB	304,0 KiB	[lista plików]
armhf	76,9 KiB	244,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	83,3 KiB	323,0 KiB	[lista plików]
i386	88,1 KiB	340,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	105,1 KiB	557,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	80,4 KiB	292,0 KiB	[lista plików]
mips64el	82,0 KiB	420,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	91,3 KiB	470,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	99,4 KiB	470,0 KiB	[lista plików]
riscv64	88,3 KiB	286,0 KiB	[lista plików]
s390x	96,2 KiB	370,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	88,4 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	75,2 KiB	2 137,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	91,4 KiB	328,0 KiB	[lista plików]