Paquet : kalign (1:3.4.0-1)

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Paquets similaires :

Alignement séquentiel multiple global et progressif

Kalign est un outil en ligne de commande pour l'alignement de séquences biologiques (ADN, ARN, proteïnes). Il utilise l'algorithme de concordance de chaînes Muth-Manber pour améliorer la précision et la vitesse de l'alignement. Il utilise une démarche d'alignement globale, progressive, enrichie par l'usage d'un algorithme de concordance de chaînes approché pour calculer les différences de séquence et par l'incorporation des correspondances locales dans tout autre alignement global.

Étiquettes: Biologie: Clustal et ALN, Protéines, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à kalign

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enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

enh: bioperl-run

scripts d'enveloppe BioPerl
enh: t-coffee

alignement multiple de séquences

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	134,4 ko	1 126,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	83,7 ko	406,0 ko	[liste des fichiers]
armel	79,2 ko	304,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	76,9 ko	244,0 ko	[liste des fichiers]
i386	88,1 ko	340,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	82,0 ko	420,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	99,4 ko	470,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	96,2 ko	370,0 ko	[liste des fichiers]