Paquet : bali-phy (3.6.0+dfsg-1)

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inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie

BAli-Phy évalue plusieurs alignements de séquence et d’arbres évolutionnaires à partir d’ADN non aligné, d’acide aminé ou de séquences de codons. BAli-Phy utilise MCMC pour évaluer les arbres évolutionnaires, la sélection positive et les longueurs de branches tout en moyennant d’autres alignements possibles. BAli-Phy peut afficher graphiquement l’ambiguïté d’alignement dans un graphe d’incertitude d’alignement (AU).

BAli-Phy peut également évaluer les phylogénies à partir d’un alignement fixé (comme MrBayes et BEAST) grâce à des modèles de substitution tels que GTR+gamma. BAli-Phy évalue automatiquement les taux relatifs de chaque gène.

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bibliothèque d'options de programmes pour C++
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0)

bibliothèque Boost de nombres aléatoires
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
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dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libstdc++6 (>= 9)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	6 034,2 ko	35 682,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	5 431,3 ko	32 438,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4 564,5 ko	29 752,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	4 260,7 ko	22 024,0 ko	[liste des fichiers]
i386	5 831,4 ko	35 044,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	5 573,4 ko	42 247,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	5 537,4 ko	40 464,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	6 131,2 ko	40 892,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	4 991,8 ko	35 522,0 ko	[liste des fichiers]