Paquet : bali-phy (3.6.1+dfsg-2 et autres)
Liens pour bali-phy
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bali-phy :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.bali-phy.org]
Paquets similaires :
inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie
BAli-Phy évalue plusieurs alignements de séquence et d’arbres évolutionnaires à partir d’ADN non aligné, d’acide aminé ou de séquences de codons. BAli-Phy utilise MCMC pour évaluer les arbres évolutionnaires, la sélection positive et les longueurs de branches tout en moyennant d’autres alignements possibles. BAli-Phy peut afficher graphiquement l’ambiguïté d’alignement dans un graphe d’incertitude d’alignement (AU).
BAli-Phy peut également évaluer les phylogénies à partir d’un alignement fixé (comme MrBayes et BEAST) grâce à des modèles de substitution tels que GTR+gamma. BAli-Phy évalue automatiquement les taux relatifs de chaque gène.
Autres paquets associés à bali-phy
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- dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)
- représentation⋅C++ d'intervalle de temps, de point temporel et d'horloges
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
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- dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)
- bibliothèque Boost de nombres aléatoires
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- rec: gnuplot
- programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- rec: r-base
- système de calcul statistique et de graphique GNU R
Télécharger bali-phy
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6 382,7 ko | 37 532,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5 733,5 ko | 35 384,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 4 895,0 ko | 31 410,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 4 485,1 ko | 23 018,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6 163,5 ko | 36 222,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5 714,9 ko | 43 529,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6 244,1 ko | 41 282,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5 010,0 ko | 35 052,0 ko | [liste des fichiers] |