Paquet : bali-phy (3.4+dfsg-1)

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inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie

BAli-Phy évalue plusieurs alignements de séquence et d’arbres évolutionnaires à partir d’ADN non aligné, d’acide aminé ou de séquences de codons. BAli-Phy utilise MCMC pour évaluer les arbres évolutionnaires, la sélection positive et les longueurs de branches tout en moyennant d’autres alignements possibles. BAli-Phy peut afficher graphiquement l’ambiguïté d’alignement dans un graphe d’incertitude d’alignement (AU).

BAli-Phy peut également évaluer les phylogénies à partir d’un alignement fixé (comme MrBayes et BEAST) grâce à des modèles de substitution tels que GTR+gamma. BAli-Phy évalue automatiquement les taux relatifs de chaque gène.

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	5 017,5 ko	25 561,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	4 682,4 ko	23 393,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	3 939,7 ko	15 849,0 ko	[liste des fichiers]
i386	4 913,3 ko	25 392,0 ko	[liste des fichiers]