[ Paquet source : bali-phy ]
Paquet : bali-phy (4.0~beta13+dfsg-1 et autres)
Liens pour bali-phy
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bali-phy :
- [bali-phy_4.0~beta13+dfsg-1.dsc]
- [bali-phy_4.0~beta13+dfsg.orig.tar.xz]
- [bali-phy_4.0~beta13+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Benjamin Redelings (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.bali-phy.org]
Paquets similaires :
Paquet « expérimental »
Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale
. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog
) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.
inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie
BAli-Phy évalue plusieurs alignements de séquence et d’arbres évolutionnaires à partir d’ADN non aligné, d’acide aminé ou de séquences de codons. BAli-Phy utilise MCMC pour évaluer les arbres évolutionnaires, la sélection positive et les longueurs de branches tout en moyennant d’autres alignements possibles. BAli-Phy peut afficher graphiquement l’ambiguïté d’alignement dans un graphe d’incertitude d’alignement (AU).
BAli-Phy peut également évaluer les phylogénies à partir d’un alignement fixé (comme MrBayes et BEAST) grâce à des modèles de substitution tels que GTR+gamma. BAli-Phy évalue automatiquement les taux relatifs de chaque gène.
Autres paquets associés à bali-phy
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- dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64, mips64el]
- représentation⋅C++ d'intervalle de temps, de point temporel et d'horloges
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- dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [non armhf, ia64, mips64el]
- représentation⋅C++ d'intervalle de temps, de point temporel et d'horloges
-
- dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [non armhf, ia64, mips64el]
- C++ containers and algorithms that implement JSON
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64, mips64el]
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [non armhf, ia64, mips64el]
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
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- dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64, mips64el]
- bibliothèque Boost de nombres aléatoires
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- dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [non armhf, ia64, mips64el]
- bibliothèque Boost de nombres aléatoires
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- dep: libc6 (>= 2.34) [armhf, mips64el]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [non armhf, ia64, mips64el]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
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- dep: libfmt9 (>= 9.1.0+ds1) [non armhf, ia64, mips64el]
- fast type-safe C++ formatting library -- library
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [armhf, ia64, mips64el]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non armhf, ia64, mips64el]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- rec: gnuplot
- programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- rec: r-base
- système de calcul statistique et de graphique GNU R
Télécharger bali-phy
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.0~beta13+dfsg-1 | 8 670,7 ko | 46 821,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 4.0~beta13+dfsg-1 | 7 785,1 ko | 43 442,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 4.0~beta2+dfsg-1 | 5 779,1 ko | 26 400,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 4.0~beta13+dfsg-1 | 8 191,7 ko | 45 415,0 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 (portage non officiel) | 4.0~beta2+dfsg-1 | 11 619,3 ko | 82 739,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 4.0~beta13+dfsg-1 | 7 417,3 ko | 42 720,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 4.0~beta2+dfsg-1 | 7 374,1 ko | 51 238,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 4.0~beta13+dfsg-1 | 8 208,0 ko | 53 261,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 4.0~beta13+dfsg-1 | 8 619,1 ko | 51 009,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 4.0~beta13+dfsg-1 | 6 799,5 ko | 43 214,0 ko | [liste des fichiers] |