Package: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

Links for biobambam2

Debian Resources:

Download Source Package biobambam2:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [gitlab.com]

Similar packages:

Værktøjer for tidlig trin behandling af sammenligningsfil

Denne pakke indeholder nogle værktøjer til at behandle BAM-filer, inklusive

 bamsormadup:   parallel sortering og dubletmarkering
 bamcollate2:   læser BAM og skriver BAM i ny rækkefølge så at
                sammenligningen eller sorteringen er efter
                forespørgselsnavn
 bammarkduplicates: læser BAM og skriver BAM med dubletsammenligninger
                    markeret via BAM-flagfelterne
 bammaskflags:  læser BAM og skriver BAM mens der skjules (fjernes)
                bit fra flagkolonnen
 bamrecompress: læser BAM og skriver BAM med en defineret
                komprimeringsindstilling. Dette værktøj kan bruge
                flere tråde.
 bamsort:       læser BAM og skriver BAM i ny rækkefølge efter
                koordinater eller forespørgelsesnavn
 bamtofastq:    læser BAM og skriver FastQ; resultatet kan være
                sorteres eller uden sortering efter forespørgelsesnavn

Other Packages Related to biobambam2

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [not ia64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

Samling af datastrukturer og algoritmer for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download biobambam2

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	9,150.3 kB	73,920.0 kB	[list of files]
amd64	9,203.8 kB	64,327.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	10,230.3 kB	117,346.0 kB	[list of files]
mips64el	7,602.0 kB	75,740.0 kB	[list of files]
ppc64el	8,944.3 kB	76,579.0 kB	[list of files]
riscv64	8,815.6 kB	51,675.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	9,225.9 kB	60,999.0 kB	[list of files]