Пакет: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

Връзки за biobambam2

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник biobambam2.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [gitlab.com]

Подобни пакети:

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Други пакети, свързани с biobambam2

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [не arm64, i386, ia64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

collection of data structures and algorithms for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Изтегляне на biobambam2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	9 150,3 кБ	73 920,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	9 203,8 кБ	64 327,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	8 563,8 кБ	64 163,0 кБ	[списък на файловете]
i386	9 933,6 кБ	71 707,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	10 230,3 кБ	117 346,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	7 602,0 кБ	75 740,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	8 944,3 кБ	76 579,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	8 815,6 кБ	51 675,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	9 225,9 кБ	60 999,0 кБ	[списък на файловете]