[ Quellcode: biobambam2 ]
Paket: biobambam2 (2.0.185+ds-2)
Links für biobambam2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket biobambam2 herunterladen:
- [biobambam2_2.0.185+ds-2.dsc]
- [biobambam2_2.0.185+ds.orig.tar.xz]
- [biobambam2_2.0.185+ds-2.debian.tar.xz]
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [gitlab.com]
Ähnliche Pakete:
tools for early stage alignment file processing
This package contains some tools for processing BAM files, including
bamsormadup: parallel sorting and duplicate marking
bamcollate2: reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
or collated by query name
bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
marked using the BAM flags field
bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
from the flags column
bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
setting. This tool is capable of multi-threading.
bamsort: reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
query name
bamtofastq: reads BAM and writes FastQ; output can be collated
or uncollated by query name
Andere Pakete mit Bezug zu biobambam2
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nicht i386, ia64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)
- collection of data structures and algorithms for biobambam
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
biobambam2 herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 9.150,3 kB | 73.920,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 9.203,8 kB | 64.327,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 9.933,6 kB | 71.707,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 10.230,3 kB | 117.346,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 7.602,0 kB | 75.740,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 8.944,3 kB | 76.579,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 8.815,6 kB | 51.675,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 9.225,9 kB | 60.999,0 kB | [Liste der Dateien] |