Package: skewer (0.2.2-2)

Links for skewer

Debian Resources:

Download Source Package skewer:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger

Skewer implementerer den bit-maskede k-forskels matchende algoritme dedikeret til opgaven med adapter-tilpasning og den er specielt designet til at behandle næstegenerations sekventering (NGS) paired-end sekvenser.

Funktioner

 * Registrering og fjernelse af adaptersekvenser
 * Indsættelse og sletning tilladt i mønstermatchning
 * Målrettet læsningerne Single End, Paired End (PE) og Long Mate
   Pair (LMP)
 * Demultiplexing af stregkodede sekventeringsafviklinger
 * Tilpasning baseret på phred-kvalitetsbedømmelser
 * IUPAC-tegn for stregkoder og adaptere
 * Komprimeret understøttelse for inddata og uddata

Other Packages Related to skewer

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3

Download skewer

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	68.2 kB	198.0 kB	[list of files]
arm64	59.4 kB	166.0 kB	[list of files]
armel	58.8 kB	174.0 kB	[list of files]
armhf	60.4 kB	130.0 kB	[list of files]
i386	71.0 kB	214.0 kB	[list of files]
mips64el	63.4 kB	212.0 kB	[list of files]
mipsel	65.1 kB	206.0 kB	[list of files]
ppc64el	65.9 kB	211.0 kB	[list of files]
s390x	60.9 kB	194.0 kB	[list of files]