Pakiet: skewer (0.2.2-2)

Odnośniki dla skewer

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego skewer:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Inne pakiety związane z skewer

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie skewer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	68,2 KiB	198,0 KiB	[lista plików]
arm64	59,4 KiB	166,0 KiB	[lista plików]
armel	58,8 KiB	174,0 KiB	[lista plików]
armhf	60,4 KiB	130,0 KiB	[lista plików]
i386	71,0 KiB	214,0 KiB	[lista plików]
mips64el	63,4 KiB	212,0 KiB	[lista plików]
mipsel	65,1 KiB	206,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	65,9 KiB	211,0 KiB	[lista plików]
s390x	60,9 KiB	194,0 KiB	[lista plików]