Paketti: skewer (0.2.2-2)

Links for skewer

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti skewer:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Muut pakettiin skewer liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi skewer

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	68.2 kt	198.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	59.4 kt	166.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	58.8 kt	174.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	60.4 kt	130.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	71.0 kt	214.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	63.4 kt	212.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	65.1 kt	206.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	65.9 kt	211.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	60.9 kt	194.0 kt	[tiedostoluettelo]