Paquet : skewer (0.2.2-2)

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Paquets similaires :

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Autres paquets associés à skewer

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, mipsel]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger skewer

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	68,2 ko	198,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	59,4 ko	166,0 ko	[liste des fichiers]
armel	58,8 ko	174,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	60,4 ko	130,0 ko	[liste des fichiers]
i386	71,0 ko	214,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	63,4 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	65,1 ko	206,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	65,9 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	60,9 ko	194,0 ko	[liste des fichiers]