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[ 原始碼： mapsembler2  ]

套件：mapsembler2（2.2.4+dfsg1-4 以及其他的）

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Debian 的資源：

下載原始碼套件 mapsembler2：

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相似套件：

bioinformatics targeted assembly software

Mapsembler2 is a targeted assembly software. It takes as input a set of NGS raw reads (fasta or fastq, gzipped or not) and a set of input sequences (starters).

It first determines if each starter is read-coherent, e.g. whether reads confirm the presence of each starter in the original sequence. Then for each read-coherent starter, Mapsembler2 outputs its sequence neighborhood as a linear sequence or as a graph, depending on the user choice.

Mapsembler2 may be used for (not limited to): 

 - Validate an assembled sequence (input as starter), e.g. from a de
   Bruijn graph assembly where read-coherence was not enforced.
 - Checks if a gene (input as starter) has an homolog in a set of reads
 - Checks if a known enzyme is present in a metagenomic NGS read set.
 - Enrich unmappable reads by extending them, possibly making them mappable
 - Checks what happens at the extremities of a contig
 - Remove contaminants or symbiont reads from a read set

其他與 mapsembler2 有關的套件

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下載 mapsembler2

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
alpha （非官方移植版） 2.2.3+dfsg-1 241。2 kB910。0 kB [檔案列表]
amd64 2.2.4+dfsg1-4 707。5 kB1，283。0 kB [檔案列表]
arm64 2.2.4+dfsg1-4+b1 690。7 kB1，443。0 kB [檔案列表]
hppa （非官方移植版） 2.2.3+dfsg-1 241。5 kB803。0 kB [檔案列表]
m68k （非官方移植版） 2.1.6+dfsg-1 262。2 kB453。0 kB [檔案列表]
ppc64 （非官方移植版） 2.2.3+dfsg-1 228。6 kB928。0 kB [檔案列表]
ppc64el 2.2.4+dfsg1-4 722。5 kB1，571。0 kB [檔案列表]
s390x 2.2.4+dfsg1-4 683。2 kB1，307。0 kB [檔案列表]
sh4 （非官方移植版） 2.1.6+dfsg-1 285。5 kB469。0 kB [檔案列表]
sparc64 （非官方移植版） 2.1.6+dfsg-1 263。1 kB458。0 kB [檔案列表]
x32 （非官方移植版） 2.2.3+dfsg-1 233。7 kB706。0 kB [檔案列表]