Пакунок: samtools (1.11-1)

Links for samtools

Debian Resources:

Download Source Package samtools:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.htslib.org]

Similar packages:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Інші пакунки пов'язані з samtools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libhts3 (>= 1.11)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

Спільні бібліотеки для роботи із терміналом
dep: libtinfo6 (>= 6)

Низькорівнева колективна бібліотека „terminfo“ для роботи з терміналом
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, i386, mipsel]

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, i386, mipsel]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Завантажити samtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	531.8 kB	1,201.0 kB	[список файлів]
arm64	513.2 kB	1,149.0 kB	[список файлів]
armel	503.0 kB	1,134.0 kB	[список файлів]
armhf	507.0 kB	978.0 kB	[список файлів]
i386	562.3 kB	1,306.0 kB	[список файлів]
mips64el	518.2 kB	1,281.0 kB	[список файлів]
mipsel	525.7 kB	1,240.0 kB	[список файлів]
ppc64el	559.1 kB	1,669.0 kB	[список файлів]
s390x	512.5 kB	1,229.0 kB	[список файлів]