Пакунок: samtools (1.20-3 and others)

Links for samtools

Debian Resources:

Download Source Package samtools:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.htslib.org]

Similar packages:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Інші пакунки пов'язані з samtools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [alpha, ia64]

C library for high-throughput sequencing data formats

dep: libhts3t64 (>= 1.20~) [not alpha, ia64]
dep: libncurses6 (>= 6)

Спільні бібліотеки для роботи із терміналом
dep: libtinfo6 (>= 6)

Низькорівнева колективна бібліотека „terminfo“ для роботи з терміналом
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Завантажити samtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.19.2-1+b1	626.8 kB	1,800.0 kB	[список файлів]
amd64	1.20-3	637.6 kB	1,409.0 kB	[список файлів]
arm64	1.20-3	609.3 kB	1,673.0 kB	[список файлів]
armel	1.20-3	601.7 kB	1,330.0 kB	[список файлів]
armhf	1.20-3	605.0 kB	1,146.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.20-3	634.3 kB	1,371.0 kB	[список файлів]
i386	1.20-3	672.3 kB	1,538.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.19.2-1+b1	716.1 kB	2,112.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.20-3	612.5 kB	1,354.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.20-3	615.2 kB	1,824.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.20-3	652.6 kB	1,929.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.20-3	662.7 kB	1,929.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.20-3	647.5 kB	1,281.0 kB	[список файлів]
s390x	1.20-3	643.8 kB	1,485.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.20-3	694.6 kB	1,668.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.20-3	601.8 kB	7,765.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.20-3	641.9 kB	1,378.0 kB	[список файлів]