Paket: samtools (1.20-3 ve diğerleri)

samtools için bağlantılar

Debian Kaynakları:

samtools Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [www.htslib.org]

Benzer paketler:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Ağ: İstemci, Ağ Protokolü: FTP, protocol::http, role::program, Kapsam: Yardımcı Araç, Arayüz Araç Takımı: Ncurses TUI, Amaç: use::analysing, use::calculating, Filtreleme, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

samtools ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [alpha, ia64]

C library for high-throughput sequencing data formats

dep: libhts3t64 (>= 1.20~) [alpha, ia64 değil]
dep: libncurses6 (>= 6)

shared libraries for terminal handling
dep: libtinfo6 (>= 6)

shared low-level terminfo library for terminal handling
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4 değil]

compression library - runtime

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

samtools indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.19.2-1+b1	626,8 kB	1.800,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.20-3	637,6 kB	1.409,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.20-3	609,3 kB	1.673,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.20-3	601,7 kB	1.330,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.20-3	605,0 kB	1.146,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.20-3	634,3 kB	1.371,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.20-3	672,3 kB	1.538,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.19.2-1+b1	716,1 kB	2.112,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.20-3	612,5 kB	1.354,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.20-3	615,2 kB	1.824,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.20-3	652,6 kB	1.929,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.20-3	662,7 kB	1.929,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.20-3	647,5 kB	1.281,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.20-3	643,8 kB	1.485,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.20-3	694,6 kB	1.668,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.20-3	601,8 kB	7.765,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.20-3	641,9 kB	1.378,0 kB	[dosya listesi]