Paket: samtools (1.9-4)

samtools için bağlantılar

Debian Kaynakları:

samtools Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [www.htslib.org]

Benzer paketler:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Ağ: İstemci, Ağ Protokolü: FTP, protocol::http, role::program, Kapsam: Yardımcı Araç, Arayüz Araç Takımı: Ncurses TUI, Amaç: use::analysing, use::calculating, Filtreleme, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

samtools ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
dep: libhts2 (>= 1.9)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

shared libraries for terminal handling
dep: libtinfo6 (>= 6)

shared low-level terminfo library for terminal handling
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armhf değil]

compression library - runtime

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]

rec: cwltool

Common Workflow Language reference implementation
rec: python

interactive high-level object-oriented language (Python2 version)

samtools indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
amd64	432,3 kB	1.008,0 kB	[dosya listesi]
arm64	413,7 kB	952,0 kB	[dosya listesi]
armhf	400,4 kB	785,0 kB	[dosya listesi]