all options
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: samtools  ]

Package: samtools (1.9-4)

Links for samtools

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package samtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Samtools er et sæt af værktøjer, der manipulerer sammenligninger af nukleotidsekvenser i det binære BAM-format. Værktøjet importerer fra og eksporterer til ascii SAM-formatet (Sequence Alignment/Map) og CRAM-formater, udfører sortering, sammenlægning og indeksering, og gør det muligt at hente læsninger i alle områder hurtigt. Det er designet til at arbejde på en strøm, og er i stand til at åbne en BAM- eller CRAM-fil (ikke SAM) på en ekstern FTP- eller HTTP-server.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to samtools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download samtools

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 432.3 kB1,008.0 kB [list of files]
arm64 413.7 kB952.0 kB [list of files]
armhf 400.4 kB785.0 kB [list of files]