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Paquet : samtools (1.9-4)

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traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

Samtools est un ensemble d'utilitaires qui manipulent les alignements de séquence de nucléotides dans le format binaire BAM. Il est capable d'importer et d'exporter à partir des formats ASCII SAM (Sequence Alignment/Map) et CRAM, de trier, de fusionner, d'indexer et de récupérer des enregistrements dans n'importe quelle région facilement. Il est conçu pour travailler sur un flux de données et est capable d'ouvrir un fichier BAM ou CRAM (mais pas SAM) sur un serveur HTTP ou FTP distant.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Réseau: Client, Protocole réseau: FTP, protocol::http, role::program, Champ d'application: Utilitaire, Boîte à outils d'interface utilisateur: Interface utilisateur texte ncurses, But: use::analysing, use::calculating, Filtrage, Fonctionne avec: Séquence biologique

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 432,3 ko1 008,0 ko [liste des fichiers]
arm64 413,7 ko952,0 ko [liste des fichiers]
armhf 400,4 ko785,0 ko [liste des fichiers]