[ Källkod: cyvcf2 ]
Paket: python3-cyvcf2 (0.31.0-1 och andra)
Länkar för python3-cyvcf2
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet cyvcf2:
Ansvariga:
- Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
- Steffen Moeller (QA-sida)
- Liubov Chuprikova (QA-sida)
- Étienne Mollier (QA-sida)
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Andra paket besläktade med python3-cyvcf2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.7) [ej alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [x32]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [ej x32]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12) [x32]
- dep: python3 (<< 3.13) [ej x32]
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [x32]
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ej x32]
-
- dep: python3-numpy-abi9
- virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy
Hämta python3-cyvcf2
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 934,5 kbyte | 5.723,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 0.31.0-1 | 983,1 kbyte | 5.498,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 0.31.0-1 | 923,9 kbyte | 5.460,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 0.31.0-1 | 923,5 kbyte | 5.332,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 0.31.0-1 | 933,7 kbyte | 4.980,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 942,9 kbyte | 5.944,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 0.31.0-1 | 985,0 kbyte | 5.558,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 0.30.28-1+b1 | 1.027,9 kbyte | 6.797,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 584,7 kbyte | 4.328,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 0.31.0-1 | 883,1 kbyte | 5.556,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 953,7 kbyte | 5.908,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 0.31.0-1 | 962,7 kbyte | 5.780,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 0.31.0-1 | 977,5 kbyte | 5.192,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 0.31.0-1 | 946,9 kbyte | 5.500,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 740,8 kbyte | 4.242,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 0.31.0-1 | 886,2 kbyte | 6.242,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 0.30.22-1 | 790,1 kbyte | 4.649,0 kbyte | [filförteckning] |