Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.0-1 и други)

Връзки за python3-cyvcf2

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник cyvcf2.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Други пакети, свързани с python3-cyvcf2

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libhts3 (>= 1.10) [x32]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [не x32]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.12) [x32]

dep: python3 (<< 3.13) [не x32]

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [x32]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [не x32]
dep: python3-numpy-abi9

виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-cyvcf2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.31.0-1	934,5 кБ	5 723,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.31.0-1	983,1 кБ	5 498,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.31.0-1	923,9 кБ	5 460,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.31.0-1	923,5 кБ	5 332,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.31.0-1	933,7 кБ	4 980,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.31.0-1	942,9 кБ	5 944,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.31.0-1	985,0 кБ	5 558,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.30.28-1+b1	1 027,9 кБ	6 797,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.31.0-1	584,7 кБ	4 328,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.31.0-1	883,1 кБ	5 556,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.31.0-1	953,7 кБ	5 908,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.31.0-1	962,7 кБ	5 780,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.31.0-1	977,5 кБ	5 192,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.31.0-1	946,9 кБ	5 500,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.31.0-1	740,8 кБ	4 242,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.31.0-1	886,2 кБ	6 242,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.30.22-1	790,1 кБ	4 649,0 кБ	[списък на файловете]