[ Source: cyvcf2 ]
Пакунок: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 and others)
Links for python3-cyvcf2
Debian Resources:
Download Source Package cyvcf2:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Liubov Chuprikova (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Інші пакунки пов'язані з python3-cyvcf2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.7) [not alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13) [ia64, x32]
- dep: python3 (<< 3.14) [not ia64, x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]
- dep: python3 (>= 3.12~) [not ia64]
-
- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy [not alpha, ia64, x32]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, ia64, x32]
-
- dep: python3-numpy-abi9 [alpha, ia64, x32]
- virtual package provided by python3-numpy
-
- dep: python3-numpy2-abi0 [not alpha, ia64, x32]
- virtual package provided by python3-numpy
- or python3-numpy-abi9
- virtual package provided by python3-numpy
Завантажити python3-cyvcf2
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 0.31.1-2+b1 | 948.1 kB | 6,526.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 0.31.1-2+b2 | 1,002.9 kB | 6,434.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 0.31.1-2+b2 | 933.2 kB | 6,222.0 kB | [список файлів] |
| armel | 0.31.1-2+b2 | 946.9 kB | 6,328.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 0.31.1-2+b2 | 952.0 kB | 5,944.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 0.31.1-2+b2 | 969.8 kB | 7,133.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 0.31.1-2+b3 | 997.0 kB | 6,525.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 0.30.28-1+b1 | 1,027.9 kB | 6,797.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 0.31.1-2+b2 | 590.6 kB | 5,131.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 0.31.1-2+b2 | 893.8 kB | 6,384.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 0.31.1-2+b2 | 954.1 kB | 6,734.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 0.31.1-2+b2 | 961.8 kB | 6,606.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 0.31.1-2+b2 | 987.6 kB | 5,988.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 0.31.1-2+b2 | 965.2 kB | 6,379.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 0.31.1-2+b2 | 767.7 kB | 5,215.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 0.31.1-2+b2 | 909.1 kB | 6,876.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 0.31.1-2 | 889.1 kB | 5,543.0 kB | [список файлів] |