Pakiet: python3-cyvcf2 (0.31.0-1 i inne)

Odnośniki dla python3-cyvcf2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego cyvcf2:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libhts3 (>= 1.10) [x32]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nie x32]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

dep: python3 (<< 3.12) [x32]

dep: python3 (<< 3.13) [nie x32]

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [x32]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [nie x32]
dep: python3-numpy-abi9

pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.31.0-1	934,5 KiB	5 723,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.31.0-1	983,1 KiB	5 498,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.31.0-1	923,9 KiB	5 460,0 KiB	[lista plików]
armel	0.31.0-1	923,5 KiB	5 332,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.31.0-1	933,7 KiB	4 980,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.31.0-1	942,9 KiB	5 944,0 KiB	[lista plików]
i386	0.31.0-1	985,0 KiB	5 558,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.30.28-1+b1	1 027,9 KiB	6 797,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.31.0-1	584,7 KiB	4 328,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.31.0-1	883,1 KiB	5 556,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.31.0-1	953,7 KiB	5 908,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.31.0-1	962,7 KiB	5 780,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.31.0-1	977,5 KiB	5 192,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.31.0-1	946,9 KiB	5 500,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.31.0-1	740,8 KiB	4 242,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.31.0-1	886,2 KiB	6 242,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.30.22-1	790,1 KiB	4 649,0 KiB	[lista plików]