[ Quellcode: cyvcf2 ]
Paket: python3-cyvcf2 (0.31.0-1 und andere)
Links für python3-cyvcf2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket cyvcf2 herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Liubov Chuprikova (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.7) [nicht alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [x32]
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nicht x32]
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12) [x32]
- dep: python3 (<< 3.13) [nicht x32]
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-click
- Wrapper um optparse für Befehlszeilenprogramme - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [x32]
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [nicht x32]
-
- dep: python3-numpy-abi9
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
python3-cyvcf2 herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 934,5 kB | 5.723,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 0.31.0-1 | 983,1 kB | 5.498,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 0.31.0-1 | 923,9 kB | 5.460,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 0.31.0-1 | 923,5 kB | 5.332,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 0.31.0-1 | 933,7 kB | 4.980,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 942,9 kB | 5.944,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 0.31.0-1 | 985,0 kB | 5.558,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 0.30.28-1+b1 | 1.027,9 kB | 6.797,0 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 584,7 kB | 4.328,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 0.31.0-1 | 883,1 kB | 5.556,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 953,7 kB | 5.908,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 0.31.0-1 | 962,7 kB | 5.780,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 0.31.0-1 | 977,5 kB | 5.192,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 0.31.0-1 | 946,9 kB | 5.500,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 740,8 kB | 4.242,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 0.31.0-1 | 886,2 kB | 6.242,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 0.30.22-1 | 790,1 kB | 4.649,0 kB | [Liste der Dateien] |