[ Zdroj: sga ]
Balík: sga (0.10.15-4)
Odkazy pre sga
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík sga:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Michael R. Crusoe (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
de novo genome assembler that uses string graphs
The major goal of SGA is to be very memory efficient, which is achieved by using a compressed representation of DNA sequence reads.
SGA is a de novo assembler for DNA sequence reads. It is based on Gene Myers' string graph formulation of assembly and uses the FM-index/Burrows-Wheeler transform to efficiently find overlaps between sequence reads.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom sga
|
|
|
|
-
- dep: libbamtools2.5.1
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.23)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: python
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
-
- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
-
- dep: python-ruffus
- knižnica výpočtovej linky v jazyku Python široko využívaná v bioinformatike
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- rec: abyss (>= 2.0.2-1)
- de novo, parallel, sequence assembler for short reads
Stiahnuť sga
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| amd64 | 954.4 kB | 2,875.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 670.7 kB | 2,011.0 kB | [zoznam súborov] |