[ ソース: nanopolish ]
パッケージ: nanopolish (0.13.2-3)
nanopolish に関するリンク
Debian の資源:
nanopolish ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
その他の nanopolish 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf, mipsel, ppc64el 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [arm64 以外]
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [arm64]
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- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
nanopolish のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 2,199.8 kB | 9,539.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 2,130.2 kB | 9,334.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 2,126.7 kB | 9,405.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 2,141.1 kB | 8,985.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 2,247.0 kB | 9,797.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 2,140.4 kB | 9,757.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 2,163.9 kB | 9,796.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 2,202.2 kB | 9,795.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 2,134.3 kB | 9,626.0 kB | [ファイル一覧] |