[ ソース: nanopolish ]
パッケージ: nanopolish (0.11.0-2)
nanopolish に関するリンク
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
その他の nanopolish 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.27)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhdf5-103
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - runtime files - serial version
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- dep: libhts2 (>= 1.4.1)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
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- rec: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)