Package: python-cogent (1.9-14 and others) [debports]

Links for python-cogent

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [pycogent.org]

Similar packages:

infrastruttura per biologia genomica

PyCogent è una libreria software per la biologia genomica. È un'infrastruttura completamente integrata e accuratamente testata per:

 * controllare applicazioni di terze parti;
 * ideare flussi di lavoro; interrogare database;
 * condurre analisi probabilistiche innovative dell'evoluzione di sequenze
   biologiche;
 * generare grafici di qualità adatta per la pubblicazione.

Si distingue per le molte funzionalità interne uniche (come un vero allineamento dei codoni) e l'aggiunta frequente di metodi completamente nuovi per l'analisi di dati genomici.

Packages providing python-cogent

python3-cogent3: infrastruttura per biologia genomica

Other Packages Related to python-cogent

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]
dep: python

Package not available

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-matplotlib

Package not available
dep: python-numpy (>= 1:1.13.1) [hppa]

Package not available

dep: python-numpy (>= 1:1.14.3) [not hppa]
dep: python-numpy-abi9

Package not available

rec: blast2

Package not available
rec: cd-hit

suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze
rec: clearcut

ricostruzione estremamente efficiente di alberi filogenetici
rec: dialign

allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti
rec: muscle

programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche

sug: cdbfasta

strumenti Constant DataBase per indicizzazione e recupero per file multi-FASTA
sug: clustalw

allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi
sug: fasttree

phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
sug: mafft

programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
sug: mothur

suite di analisi di sequenze per ricerche su microrganismi
sug: parsinsert

INSERimenTo PARSimonioso di sequenze non classificate in alberi filogenetici
sug: python-cogent-doc

documentazione per python3-cogent3
sug: rdp-classifier

extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
sug: rtax

classificazione di letture di sequenze di geni per RNA ribosomiale 16S

Download python-cogent

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	1.9-11+b1	2,388.2 kB	7,890.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.9-14	2,420.6 kB	7,527.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.9-14	2,357.1 kB	7,877.0 kB	[list of files]