Package: libbwa-dev (0.7.18-1 and others)

Links for libbwa-dev

Debian Resources:

Download Source Package bwa:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Carlos Borroto (QA Page)
Ognyan Kulev (QA Page)
Michael R. Crusoe (QA Page)

External Resources:

Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]

Similar packages:

file sorgenti di Burrows-Wheeler Aligner

BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.

Questo pacchetto contiene i file sorgenti per l'uso in altri programmi.

Tags: Software Development: Libraries, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Source Code, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to libbwa-dev

depends

recommends

suggests

enhances

sug: samtools

elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Download libbwa-dev

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.7.18-1	167.9 kB	626.0 kB	[list of files]
amd64	0.7.18-1	152.0 kB	479.0 kB	[list of files]
arm64	0.7.18-1	147.0 kB	472.0 kB	[list of files]
armel	0.7.18-1	147.3 kB	435.0 kB	[list of files]
armhf	0.7.18-1	147.3 kB	365.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.7.18-1	169.7 kB	484.0 kB	[list of files]
i386	0.7.18-1	168.4 kB	482.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.7.17-7+b4	204.9 kB	764.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.7.18-1	149.0 kB	446.0 kB	[list of files]
mips64el	0.7.18-1	160.8 kB	568.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.7.18-1	165.0 kB	554.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.7.18-1	173.8 kB	567.0 kB	[list of files]
riscv64	0.7.18-1	300.8 kB	2,340.0 kB	[list of files]
s390x	0.7.18-1	165.3 kB	519.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.7.18-1	200.6 kB	439.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.7.18-1	140.9 kB	482.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.7.18-1	155.4 kB	447.0 kB	[list of files]