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Package: libbwa-dev (0.7.17-6 and others)

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file sorgenti di Burrows-Wheeler Aligner

BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.

Questo pacchetto contiene i file sorgenti per l'uso in altri programmi.

Tags: Software Development: Libraries, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Source Code, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 0.7.17-6+b1 139.9 kB406.0 kB [list of files]
arm64 0.7.17-6+b1 135.1 kB402.0 kB [list of files]
armel 0.7.17-6+b1 134.0 kB363.0 kB [list of files]
armhf 0.7.17-6+b1 134.9 kB295.0 kB [list of files]
i386 0.7.17-6+b1 160.4 kB425.0 kB [list of files]
mips64el 0.7.17-6+b1 149.4 kB499.0 kB [list of files]
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ppc64el 0.7.17-6+b1 154.6 kB477.0 kB [list of files]
s390x 0.7.17-6+b1 132.8 kB422.0 kB [list of files]