[ Source: samtools ]
Package: samtools (1.21-1)
Links for samtools
Debian Resources:
Download Source Package samtools:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.htslib.org]
Similar packages:
Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
Samtools er et sæt af værktøjer, der manipulerer sammenligninger af nukleotidsekvenser i det binære BAM-format. Værktøjet importerer fra og eksporterer til ascii SAM-formatet (Sequence Alignment/Map) og CRAM-formater, udfører sortering, sammenlægning og indeksering, og gør det muligt at hente læsninger i alle områder hurtigt. Det er designet til at arbejde på en strøm, og er i stand til at åbne en BAM- eller CRAM-fil (ikke SAM) på en ekstern FTP- eller HTTP-server.
Other Packages Related to samtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.21)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libncurses6 (>= 6)
- delte biblioteker til terminalhåndtering
-
- dep: libtinfo6 (>= 6)
- delt terminfo-bibliotek på lavt niveau for terminalhåndtering
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, i386]
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, i386]
-
- sug: cwltool
- Common Workflow Language - referenceimplementering
Download samtools
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 651.5 kB | 1,447.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 622.5 kB | 1,679.0 kB | [list of files] |
| armel | 614.7 kB | 1,672.0 kB | [list of files] |
| armhf | 617.9 kB | 1,544.0 kB | [list of files] |
| i386 | 683.3 kB | 1,572.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 630.8 kB | 1,894.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 677.4 kB | 1,935.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 657.6 kB | 1,299.0 kB | [list of files] |
| s390x | 655.9 kB | 1,507.0 kB | [list of files] |