all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: seqtools  ]

Package: blixem (4.44.1+dfsg-6 and others)

Links for blixem

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package seqtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

Blixem er en interaktiv browser for sekvenssammenligninger, som er blevet stablet op i en »master-slave« multiple-sammenligning; det er ikke en »sand« multiple-sammenligning men en »en til mange«-sammenligning.

 * Overblikssektion der viser positionerne for gener og sammenligninger
   omkring sammenligningsvinduet
 * Detaljesektion der viser den faktiske sammenligning af proteinsekvenser
   eller nukleotid sekvenser til den genomiske DNA-sekvens
 * Vis sammenligninger mod begge tråde af referencesekvensen
 * Vis sekvenser i nukleotid eller proteintilstand; i proteintilstand vil
   Blixem vise tre-ramme oversættelsen af referencesekvensen
 * Rester fremhæves i forskellige farver afhængig af om de er præcise
   match, bevaret erstatning eller uden match
 * Hullede sammenligninger er understøttet, med indsættelser og sletning
   før fremhævelse i matchsekvensen
 * Matchninger kan sorteres og filtreres
 * SNP'er og andre variationer kan fremhæves i referencesekvensen
 * Poly(A)-haler kan vises og poly(A)-signaler fremhævet i
   referencesekvensen

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download blixem

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 4.44.1+dfsg-6+b1 1,358.0 kB2,256.0 kB [list of files]
arm64 4.44.1+dfsg-6+b1 1,320.3 kB2,202.0 kB [list of files]
armel 4.44.1+dfsg-6+b1 1,299.1 kB2,072.0 kB [list of files]
armhf 4.44.1+dfsg-6+b1 1,305.6 kB1,820.0 kB [list of files]
i386 4.44.1+dfsg-6+b1 1,372.7 kB2,424.0 kB [list of files]
mips64el 4.44.1+dfsg-6+b1 1,343.4 kB2,639.0 kB [list of files]
mipsel 4.44.1+dfsg-6+b1 1,349.7 kB2,561.0 kB [list of files]
ppc64el 4.44.1+dfsg-6+b1 1,358.2 kB2,676.0 kB [list of files]
s390x 4.44.1+dfsg-6+b1 1,321.3 kB2,306.0 kB [list of files]