パッケージ: blixem (4.44.1+dfsg-6 など)

blixem に関するリンク

Debian の資源:

seqtools ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.sanger.ac.uk]

類似のパッケージ:

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

タグ: インタフェースツールキット: GTK

その他の blixem 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libcurl4 (>= 7.16.2)

使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
dep: libgbtools0 (>= 4.44.1+dfsg)

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

C ルーチンの GLib ライブラリ
dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0)

GTK graphical user interface library - old version
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

国際化されたテキストのレイアウトと描画
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

SQLite 3 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

blixem のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	4.44.1+dfsg-6+b1	1,358.0 kB	2,256.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.44.1+dfsg-6+b1	1,320.3 kB	2,202.0 kB	[ファイル一覧]
armel	4.44.1+dfsg-6+b1	1,299.1 kB	2,072.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.44.1+dfsg-6+b1	1,305.6 kB	1,820.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.44.1+dfsg-6+b1	1,372.7 kB	2,424.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.44.1+dfsg-6+b1	1,343.4 kB	2,639.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	4.44.1+dfsg-6+b1	1,349.7 kB	2,561.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.44.1+dfsg-6+b1	1,358.2 kB	2,676.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.44.1+dfsg-6+b1	1,321.3 kB	2,306.0 kB	[ファイル一覧]