Package: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

Links for blixem

Debian Resources:

Download Source Package seqtools:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [www.sanger.ac.uk]

Similar packages:

Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

Blixem er en interaktiv browser for sekvenssammenligninger, som er blevet stablet op i en »master-slave« multiple-sammenligning; det er ikke en »sand« multiple-sammenligning men en »en til mange«-sammenligning.

 * Overblikssektion der viser positionerne for gener og sammenligninger
   omkring sammenligningsvinduet
 * Detaljesektion der viser den faktiske sammenligning af proteinsekvenser
   eller nukleotid sekvenser til den genomiske DNA-sekvens
 * Vis sammenligninger mod begge tråde af referencesekvensen
 * Vis sekvenser i nukleotid eller proteintilstand; i proteintilstand vil
   Blixem vise tre-ramme oversættelsen af referencesekvensen
 * Rester fremhæves i forskellige farver afhængig af om de er præcise
   match, bevaret erstatning eller uden match
 * Hullede sammenligninger er understøttet, med indsættelser og sletning
   før fremhævelse i matchsekvensen
 * Matchninger kan sorteres og filtreres
 * SNP'er og andre variationer kan fremhæves i referencesekvensen
 * Poly(A)-haler kan vises og poly(A)-signaler fremhævet i
   referencesekvensen

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

Værktøjssættet til ATK-tilgængelighed
dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [not alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)
dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

bibliotek til konfiguration af generiske skrifttyper - kørselstid
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

FreeType 2-skriftmotor - delte biblioteksfiler
dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

Bibliotek til at visualisere sekvenssammenligninger
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC støttebibliotek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC støttebibliotek
dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

GDK Pixbuf-bibliotek
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

GLib-bibliotek for C-rutiner
dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0) [alpha, sparc64]

Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK - ældre version
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0) [not alpha, sparc64]

Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK - ældre version
dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

OpenType-tekstformningsmotor - delt bibliotek
dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [sparc64]

Bibliotek til at læse og skrive JSON for C++
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

Layout og optegning af internationaliseret tekst
dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

Layout og optegning af internationaliseret tekst
dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

Layout og optegning af internationaliseret tekst
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

Delt bibliotek til SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

Download blixem

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,327.0 kB	2,429.0 kB	[list of files]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,347.5 kB	2,220.0 kB	[list of files]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,314.2 kB	2,290.0 kB	[list of files]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,292.4 kB	2,060.0 kB	[list of files]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,298.9 kB	1,820.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,333.3 kB	2,197.0 kB	[list of files]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,360.8 kB	2,356.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,339.1 kB	2,245.0 kB	[list of files]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,340.2 kB	2,634.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,346.7 kB	2,675.0 kB	[list of files]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,346.5 kB	2,548.0 kB	[list of files]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,340.1 kB	2,020.0 kB	[list of files]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,322.3 kB	2,266.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,361.6 kB	2,227.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,295.2 kB	3,224.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,348.7 kB	2,155.0 kB	[list of files]