[ Source: tiddit ]
Package: tiddit (3.5.2+dfsg-1)
Links for tiddit
Debian Resources:
Download Source Package tiddit:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Strukturel variant-kald
TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.
TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.
Other Packages Related to tiddit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, ppc64el]
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
Download tiddit
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 265.3 kB | 1,151.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 213.8 kB | 1,187.0 kB | [list of files] |
| armel | 222.8 kB | 965.0 kB | [list of files] |
| armhf | 225.4 kB | 677.0 kB | [list of files] |
| i386 | 246.9 kB | 1,069.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 199.6 kB | 1,332.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 201.2 kB | 1,242.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 228.7 kB | 1,315.0 kB | [list of files] |