Пакет: tiddit (3.5.2+dfsg-1)

Ссылки для tiddit

Ресурсы Debian:

Исходный код tiddit:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

Другие пакеты, относящиеся к tiddit

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.4) [не arm64, ppc64el]
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

dep: python3 (<< 3.12)

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-joblib

tools to provide lightweight pipelining in Python
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Загрузка tiddit

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	265,3 Кб	1 151,0 Кб	[список файлов]
arm64	213,8 Кб	1 187,0 Кб	[список файлов]
armel	222,8 Кб	965,0 Кб	[список файлов]
armhf	225,4 Кб	677,0 Кб	[список файлов]
i386	246,9 Кб	1 069,0 Кб	[список файлов]
mips64el	199,6 Кб	1 332,0 Кб	[список файлов]
mipsel	201,2 Кб	1 242,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	228,7 Кб	1 315,0 Кб	[список файлов]