套件：flye（2.9.4+dfsg-1 以及其他的）

flye 的相關連結

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主頁 [github.com]

相似套件：

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

其他與 flye 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 alpha, ia64, riscv64]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 flye

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	2.9.4+dfsg-1	22，591。3 kB	37，052。0 kB	[檔案列表]
amd64	2.9.4+dfsg-1	22，637。6 kB	36，914。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.9.4+dfsg-1	22，558。7 kB	36，729。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	2.9.3+dfsg2-1	22，763。6 kB	38，428。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.9.4+dfsg-1	22，557。9 kB	37，104。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.9.4+dfsg-1	22，628。7 kB	37，242。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.9.4+dfsg-1	22，638。1 kB	37，177。0 kB	[檔案列表]
riscv64	2.9.4+dfsg-1	22，616。0 kB	36，509。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.9.4+dfsg-1	22，668。1 kB	37，097。0 kB	[檔案列表]