Pakiet: flye (2.9.4+dfsg-1 i inne)

Odnośniki dla flye

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego flye:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Inne pakiety związane z flye

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, ia64, riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie flye

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.9.4+dfsg-1	22 591,3 KiB	37 052,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.9.4+dfsg-1	22 637,6 KiB	36 914,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.9.4+dfsg-1	22 558,7 KiB	36 729,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.9.3+dfsg2-1	22 763,6 KiB	38 428,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.9.4+dfsg-1	22 557,9 KiB	37 104,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.9.4+dfsg-1	22 628,7 KiB	37 242,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.9.4+dfsg-1	22 638,1 KiB	37 177,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.9.4+dfsg-1	22 616,0 KiB	36 509,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.9.4+dfsg-1	22 668,1 KiB	37 097,0 KiB	[lista plików]