[ Source: stacks ]
Пакунок: stacks (2.68+dfsg-1 and others)
Links for stacks
Debian Resources:
Download Source Package stacks:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [creskolab.uoregon.edu]
Similar packages:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Інші пакунки пов'язані з stacks
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- extra utilities from 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libdbi-perl
- Perl-інтерфес до базданих (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not ia64, m68k]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
also a virtual package provided by r-cran-littler
-
- sug: gdb
- GNU Debugger
also a virtual package provided by gdb-minimal
Завантажити stacks
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,111.6 kB | 6,814.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 2.68+dfsg-1 | 1,229.7 kB | 6,153.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 2.68+dfsg-1 | 1,053.9 kB | 5,829.0 kB | [список файлів] |
| armel | 2.68+dfsg-1 | 1,021.0 kB | 5,341.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 2.68+dfsg-1 | 1,044.3 kB | 3,781.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,082.3 kB | 5,474.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 2.68+dfsg-1 | 1,299.2 kB | 6,437.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1,286.9 kB | 11,193.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,101.0 kB | 5,753.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 2.68+dfsg-1 | 1,102.8 kB | 7,664.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,151.8 kB | 7,749.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 2.68+dfsg-1 | 1,168.3 kB | 7,109.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 2.68+dfsg-1 | 1,145.9 kB | 4,405.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 2.68+dfsg-1 | 1,156.0 kB | 6,289.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,347.3 kB | 5,689.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 983.6 kB | 12,602.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 2.68+dfsg-1 | 1,235.1 kB | 5,813.0 kB | [список файлів] |