[ Kaynak: stacks ]
Paket: stacks (2.66+dfsg-1 ve diğerleri)
stacks için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
stacks Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
- Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)
- Tim Booth (QA Sayfası)
- Andreas Tille (QA Sayfası)
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [creskolab.uoregon.edu]
Benzer paketler:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
stacks ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- extra utilities from 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl Database Interface (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, ppc64el değil]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- compression library - runtime
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket r-cran-littler
-
- sug: gdb
- GNU Debugger
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gdb-minimal
stacks indir
| Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.154,6 kB | 5.807,0 kB | [dosya listesi] |
| arm64 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.004,8 kB | 5.725,0 kB | [dosya listesi] |
| armel | 2.66+dfsg-1+b1 | 979,6 kB | 5.148,0 kB | [dosya listesi] |
| armhf | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.000,0 kB | 3.632,0 kB | [dosya listesi] |
| i386 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.233,2 kB | 6.100,0 kB | [dosya listesi] |
| mips64el | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.062,3 kB | 7.443,0 kB | [dosya listesi] |
| ppc64el | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.123,6 kB | 7.005,0 kB | [dosya listesi] |
| s390x | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.104,7 kB | 6.049,0 kB | [dosya listesi] |