Paket: rna-star (2.7.11b+dfsg-1 ve diğerleri)
rna-star için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
rna-star Kaynak Paketini İndir:
- [rna-star_2.7.11b+dfsg-1.dsc]
- [rna-star_2.7.11b+dfsg.orig.tar.xz]
- [rna-star_2.7.11b+dfsg-1.debian.tar.xz]
Geliştiriciler:
- Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)
- Steffen Moeller (QA Sayfası)
- Andreas Tille (QA Sayfası)
- Sascha Steinbiss (QA Sayfası)
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [github.com]
Benzer paketler:
ultrafast universal RNA-seq aligner
Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR) software based on a previously undescribed RNA-seq alignment algorithm that uses sequential maximum mappable seed search in uncompressed suffix arrays followed by seed clustering and stitching procedure. STAR outperforms other aligners by a factor of >50 in mapping speed, aligning to the human genome 550 million 2 × 76 bp paired-end reads per hour on a modest 12-core server, while at the same time improving alignment sensitivity and precision. In addition to unbiased de novo detection of canonical junctions, STAR can discover non-canonical splices and chimeric (fusion) transcripts, and is also capable of mapping full-length RNA sequences. Using Roche 454 sequencing of reverse transcription polymerase chain reaction amplicons, the authors experimentally validated 1960 novel intergenic splice junctions with an 80-90% success rate, corroborating the high precision of the STAR mapping strategy.
rna-star ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, sh4, x32 değil]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, mips64el]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1) [x32]
- Paket mevcut değil
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Paket mevcut değil
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9) [x32]
- GCC OpenMP (GOMP) support library
- dep: libgomp1 (>= 6) [m68k, sh4, x32 değil]
-
- dep: libhts1 (>= 1.0) [m68k, sh4, x32]
- Paket mevcut değil
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [m68k, sh4, x32 değil]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k, sh4, x32 değil]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 4.9) [sh4]
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, x32]
rna-star indir
Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.7.11b+dfsg-1+b1 | 3.363,4 kB | 21.608,0 kB | [dosya listesi] |
arm64 | 2.7.11b+dfsg-1+b1 | 702,8 kB | 2.572,0 kB | [dosya listesi] |
m68k (resmi olmayan port) | 2.4.2a+dfsg-1+b1 | 314,5 kB | 691,0 kB | [dosya listesi] |
mips64el | 2.7.11b+dfsg-1+b1 | 678,8 kB | 3.000,0 kB | [dosya listesi] |
ppc64el | 2.7.11b+dfsg-1+b1 | 745,0 kB | 2.956,0 kB | [dosya listesi] |
sh4 (resmi olmayan port) | 2.4.2a+dfsg-1 | 405,5 kB | 734,0 kB | [dosya listesi] |
x32 (resmi olmayan port) | 2.5.2a+dfsg-2 | 361,0 kB | 797,0 kB | [dosya listesi] |