Paket: canu (2.2+dfsg-5 ve diğerleri)

canu için bağlantılar

Debian Kaynakları:

canu Kaynak Paketini İndir:

Geliştirici:

Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [canu.readthedocs.org]

Benzer paketler:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

canu ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: gnuplot [alpha, m68k, sh4]

Command-line driven interactive plotting program.
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: gnuplot-nox [alpha, m68k, sh4 değil]

Command-line driven interactive plotting program. No-X package
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gnuplot-qt, gnuplot-x11

ya da gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, m68k, sh4 değil]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [alpha, m68k, sparc64 değil]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libsnappy1v5 (>= 1.1.10) [alpha, m68k, sh4, sparc64 değil]

fast compression/decompression library

dep: libsnappy1v5 (>= 1.1.8) [sparc64]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: mhap

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus [alpha, m68k, sh4]

Paket mevcut değil

canu indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	2.0+dfsg-2	1.228,8 kB	10.538,0 kB	[dosya listesi]
amd64	2.2+dfsg-5	1.379,8 kB	13.027,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.2+dfsg-5	1.272,2 kB	13.789,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	2.2+dfsg-5	1.553,6 kB	23.779,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	2.0+dfsg-2	1.280,7 kB	9.544,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.2+dfsg-5	1.566,0 kB	17.652,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	2.2+dfsg-5	1.419,2 kB	17.724,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.2+dfsg-5	1.410,8 kB	16.873,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	2.2+dfsg-5+b1	1.862,0 kB	15.534,0 kB	[dosya listesi]
s390x	2.2+dfsg-5	1.340,9 kB	13.853,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	2.0+dfsg-2	1.230,0 kB	8.637,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	2.2+dfsg-5	1.507,0 kB	50.253,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	2.2+dfsg-5	1.386,5 kB	12.548,0 kB	[dosya listesi]