Paket: tophat (2.1.1+dfsg1-2 ve diğerleri)
tophat için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
tophat Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
- Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)
- Carlos Borroto (QA Sayfası)
- Alexandre Mestiashvili (QA Sayfası)
- Andreas Tille (QA Sayfası)
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [ccb.jhu.edu]
Benzer paketler:
fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
TopHat aligns RNA-Seq reads to mammalian-sized genomes using the ultra high-throughput short read aligner Bowtie, and then analyzes the mapping results to identify splice junctions between exons. TopHat is a collaborative effort between the University of Maryland Center for Bioinformatics and Computational Biology and the University of California, Berkeley Departments of Mathematics and Molecular and Cell Biology.
tophat ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
-
- dep: libboost-thread1.67.0
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.15) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
-
- dep: samtools (>= 1.5)
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- compression library - runtime
-
- sug: cufflinks
- Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
tophat indir
Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.1.1+dfsg1-2+b1 | 654,2 kB | 3.832,0 kB | [dosya listesi] |
arm64 | 2.1.1+dfsg1-2+b1 | 591,7 kB | 3.567,0 kB | [dosya listesi] |