Balík: prime-phylo (1.0.11-11 a iné)

Odkazy pre prime-phylo

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík prime-phylo:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [prime.sbc.su.se]

Podobné balíky:

bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.

The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom prime-phylo

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libblas3

referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

alebo libblas.so.3

virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

rozhranie jazyka C++ ku MPI (Message Passing Interface)
dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

rozhranie jazyka C++ ku MPI (Message Passing Interface)
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

knižnica na serializáciu pre C++
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

knižnica na serializáciu pre C++
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, x32]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

podporná knižnica GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

podporná knižnica GCC
dep: liblapack3

knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

alebo liblapack.so.3

virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.6) [alpha]

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [nie alpha]

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-9) [alpha]
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: libxml2 (>= 2.7.4)

knižnica GNOME XML
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

sug: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
sug: mrbayes

Bayesian Inference of Phylogeny
sug: muscle

Multiple alignment program of protein sequences
sug: njplot

program na kreslenie fylogenetických stromov
sug: phyml

Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
sug: probalign

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
sug: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
sug: raxml

Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
sug: treeviewx

Displays and prints phylogenetic trees

Stiahnuť prime-phylo

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.0.11-10+b1	751.7 kB	3,724.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.0.11-11	825.5 kB	3,220.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0.11-11	734.7 kB	3,379.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0.11-11	695.0 kB	2,648.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0.11-11	707.0 kB	2,092.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.0.11-11	818.0 kB	3,309.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0.11-11	884.5 kB	3,176.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.0.11-11	892.6 kB	5,266.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.0.11-11	789.0 kB	2,992.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0.11-11	691.4 kB	3,788.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.0.11-11	817.3 kB	4,212.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0.11-11	820.6 kB	3,891.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0.11-11	809.1 kB	2,623.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.0.11-11	798.7 kB	3,247.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.0.11-11	908.2 kB	3,255.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.0.11-11	671.9 kB	13,517.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.0.11-11	832.6 kB	2,940.0 kB	[zoznam súborov]