Pakiet: prime-phylo (1.0.11-11 i inne)

Odnośniki dla prime-phylo

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego prime-phylo:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [prime.sbc.su.se]

Podobne pakiety:

bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.

The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.

Inne pakiety związane z prime-phylo

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

serialization library for C++
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

serialization library for C++
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, x32]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

lub liblapack.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.6) [alpha]

high performance message passing library -- shared library
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [nie alpha]

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-9) [alpha]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: libxml2 (>= 2.7.4)

Biblioteka GNOME XML
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

sug: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
sug: mrbayes

Bayesian Inference of Phylogeny
sug: muscle

Multiple alignment program of protein sequences
sug: njplot

phylogenetic tree drawing program
sug: phyml

Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
sug: probalign

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
sug: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
sug: raxml

Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych
sug: treeviewx

Wyświetla i drukuje drzewa filogenetyczne

Pobieranie prime-phylo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.11-10+b1	751,7 KiB	3 724,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.11-11	825,5 KiB	3 220,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.11-11	734,7 KiB	3 379,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.11-11	695,0 KiB	2 648,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.11-11	707,0 KiB	2 092,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.11-11	818,0 KiB	3 309,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.11-11	884,5 KiB	3 176,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.11-11	892,6 KiB	5 266,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.11-11	789,0 KiB	2 992,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.11-11	691,4 KiB	3 788,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.11-11	817,3 KiB	4 212,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.11-11	820,6 KiB	3 891,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.11-11	809,1 KiB	2 623,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.11-11	798,7 KiB	3 247,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.11-11	908,2 KiB	3 255,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.11-11	671,9 KiB	13 517,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.11-11	832,6 KiB	2 940,0 KiB	[lista plików]