Пакет: cd-hit (4.8.1-4 и другие)

Ссылки для cd-hit

Ресурсы Debian:

Исходный код cd-hit:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [weizhongli-lab.org]

Подобные пакеты:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::comparing, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cd-hit

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [не riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка cd-hit

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.8.1-4	505,8 Кб	1 531,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.8.1-4	510,3 Кб	1 411,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.8.1-4	493,8 Кб	1 309,0 Кб	[список файлов]
armel	4.8.1-4	491,0 Кб	1 319,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.8.1-4	487,6 Кб	1 111,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	4.8.1-4	506,3 Кб	1 398,0 Кб	[список файлов]
i386	4.8.1-4	511,4 Кб	1 477,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	4.8.1-4	525,4 Кб	2 178,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.8.1-4	506,1 Кб	1 423,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.8.1-4	510,9 Кб	1 588,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	4.8.1-4	509,0 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.8.1-4	508,7 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.8.1-4+b1	505,5 Кб	1 236,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.8.1-4	496,6 Кб	1 429,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.8.1-4	510,8 Кб	1 373,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.8.1-4	489,5 Кб	1 399,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	4.8.1-4	506,8 Кб	1 381,0 Кб	[список файлов]